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與兒童哮喘有關(guān)的DNA甲基化特征可能為疾病發(fā)病機(jī)制提供新的見解。我們做了一個(gè)表觀遺傳關(guān)聯(lián)研究來評(píng)估甲基化與兒童哮喘的關(guān)系。我們?cè)谶^敏發(fā)生機(jī)理研究(MeDALL)項(xiàng)目中進(jìn)行了一項(xiàng)大規(guī)模的表觀基因組關(guān)聯(lián)研究(EWAS)。

在西方，過敏性疾病在上升，眾所周知的過敏保護(hù)與驅(qū)動(dòng)因素如微生物和飲食暴露、污染和吸煙通過改變表觀遺傳景觀來介導(dǎo)它們的影響力。這里，我們回顧了過敏性疾病中參與的表觀遺傳學(xué)改變，總結(jié)和批判性地評(píng)估表觀遺傳學(xué)相關(guān)研究中經(jīng)驗(yàn)教訓(xùn)。我們展示了表觀遺傳學(xué)在臨床中的各種應(yīng)用：作為診斷工具，評(píng)估免疫治療后的耐受或在早期可能性地預(yù)測(cè)治療的效果。另外，新的技術(shù)進(jìn)步如表觀基因組編輯一種脫氧核酶在將來可以對(duì)表觀基因組進(jìn)行目標(biāo)性的修飾并提供新的治療工具。

從“癥狀到分子” 的經(jīng)典過敏診斷包括：1）臨床病史，2）皮膚點(diǎn)刺試驗(yàn)，3）最近的新方法：分子學(xué)過敏診斷。我們的目的是檢驗(yàn)“從分子到癥狀”這個(gè)新的替換方法的診斷的精確性，這個(gè)方法在一個(gè)回顧性的研究中得到歐洲過敏與臨床免疫學(xué)會(huì)的推薦。

① 全基因組協(xié)會(huì)（GWA）的研究已經(jīng)明確與哮喘發(fā)生相關(guān)的基因，但是沒有研究哮喘緩解；② 臨床緩解（ClinR）的定義是，最近一年中沒有哮喘治療和喘息，最近3年內(nèi)無哮喘發(fā)作，完全緩解（ComR）在臨床緩解的條件基礎(chǔ)上，還必須保持正常肺功能和無支氣管高反應(yīng)性（BHR）；③ 評(píng)估了2個(gè)獨(dú)立群體(總n = 456)中25個(gè)頂端單核苷酸多態(tài)性(SNPs)的復(fù)制情況，然后對(duì)肺組織和上皮細(xì)胞中4個(gè)復(fù)制的SNP進(jìn)行定量位點(diǎn)表達(dá)(eQTL)分析；

① 先前有研究定義了成人哮喘的轉(zhuǎn)錄子亞型，然而這并不容易應(yīng)用于臨床，尤其是兒童哮喘；② 應(yīng)用Illumina芯片技術(shù)檢測(cè)133例哮喘患兒和11例健康對(duì)照的PBMC基因表達(dá)情況；③采用了2048個(gè)基因的k-means聚類算法將哮喘患兒分組；④ 84基因特征可以識(shí)別兒童重癥哮喘的白細(xì)胞，以及成人重癥哮喘的CD8+T細(xì)胞；⑤ PBMC和CD8+T細(xì)胞可作為重癥哮喘研究和鑒別的重要靶點(diǎn)

①植物和昆蟲毒液中交叉反應(yīng)性碳水化合物決定因子(CCDs)是體外過敏診斷中假陽性檢測(cè)結(jié)果的常見原因。我們觀察到，在使用Phadia ImmunoCAP平臺(tái)時(shí)，一些CCD陽性血清甚至與無CCD的重組變應(yīng)原發(fā)生非特異性IgE結(jié)合。②我們研究了ImmunoCAP中作為過敏原蛋白載體的纖維素中是否隱藏有N –多糖殘基,在CCD陽性血清中引起非特異性結(jié)合。③在CCD陽性血清中，在應(yīng)用CCD抑制劑(MUXF3–人血清白蛋白)進(jìn)行抑制前后，對(duì)IgE與偶聯(lián)有鏈霉親和素(SA-CAP-1 或 2)或非過敏性麥芽結(jié)合蛋白(MBP; MBP-CAP-1 至 4)的6種空白ImmunoCAP樣本結(jié)合能力以及IgE與4種重組過敏原的結(jié)合能力進(jìn)行比較。③在SA-CAP-1檢測(cè)的52例CCD陽性血清(菠蘿蛋白酶, 1.01-59.6 kUA/L)中，35例(67%)IgE結(jié)合大于0.35 kUA/L (0.41-4.22 kUA/L)。在抗CCD IgE水平大于7.0 kUA/L的人群中，90%(26/29)為陽性。

本文綜述了過敏性疾病的發(fā)病機(jī)制，特別是2型先天淋巴樣細(xì)胞、TH2淋巴細(xì)胞、B細(xì)胞、樹突狀細(xì)胞、人體微生物組和屏障功能、嗜酸性粒細(xì)胞和肥大細(xì)胞方面的機(jī)理。在過去的一年里，在適應(yīng)性(TH2)和2型先天淋巴樣效應(yīng)細(xì)胞控制的2型炎癥的特征方面取得了相當(dāng)大的進(jìn)展。淋巴細(xì)胞活化、轉(zhuǎn)運(yùn)、募集和效應(yīng)細(xì)胞機(jī)制的新途徑已經(jīng)被發(fā)現(xiàn)。淋巴細(xì)胞效應(yīng)細(xì)胞應(yīng)答的可塑性是另一個(gè)取得重大進(jìn)展的領(lǐng)域。越來越多的證據(jù)將影響我們對(duì)過敏性疾病的理解以及我們預(yù)防和治療過敏的努力。

變態(tài)反應(yīng)性疾病的特征是臨床癥狀和實(shí)驗(yàn)室參數(shù)晝夜變化明顯。最近的報(bào)告表明，生物鐘在行為和生理上以大約24小時(shí)的周期驅(qū)動(dòng)著生物節(jié)律，它決定過敏反應(yīng)一天內(nèi)依賴變化的時(shí)間。新的研究還表明，生物鐘活動(dòng)的中斷不僅會(huì)影響時(shí)間節(jié)奏的變化，還會(huì)增加過敏反應(yīng)的嚴(yán)重程度，甚至?xí)黾訉?duì)過敏性疾病的易感性。這些發(fā)現(xiàn)表明，生物鐘是過敏反應(yīng)的一個(gè)強(qiáng)有力的調(diào)節(jié)器，在過敏中起著比簡(jiǎn)單的生物鐘更重要的作用。對(duì)這些過程的更好理解將為以前未知的過敏生物學(xué)方面提供新的見解，并可能導(dǎo)致應(yīng)用時(shí)鐘調(diào)節(jié)器治療過敏性疾病。最后，這一研究領(lǐng)域提供了一個(gè)全新的機(jī)會(huì)，讓我們考慮發(fā)達(dá)國家的現(xiàn)代生活方式如何改變過敏的臨床表現(xiàn)，因?yàn)槲覀兊纳鐣?huì)正迅速轉(zhuǎn)變?yōu)橐粋€(gè)晝夜節(jié)律紊亂的社會(huì)，在這個(gè)社會(huì)中，睡眠、工作和飲食習(xí)慣與內(nèi)源性晝夜節(jié)律不同步。這些發(fā)現(xiàn)可能使我們揭示更好地控制過敏性疾病的生活方式的干預(yù)。

革蘭氏陽性和革蘭陰性菌抗原的IgE反應(yīng)性在呼吸和皮膚過敏的患者中很常見，但其致敏途徑和機(jī)制尚不完全清楚。對(duì)室內(nèi)塵螨(HDM)基因組、轉(zhuǎn)錄組和微生物群的分析表明，金黃色葡萄球菌(S.金葡菌)和大腸埃希菌(E.coli)是HDM菌群中豐富的細(xì)菌。因此，我們的目的是研究HDM是否是導(dǎo)致特應(yīng)性皮炎患者IgE致敏的細(xì)菌抗原攜帶者。

① 近年來食物過敏的流行導(dǎo)致急需尋找安全有效的免疫治療方式；② 皮膚免疫治療（EPIT）在小鼠中的研究得到了安全有效的數(shù)據(jù)；③ 小鼠模型還發(fā)現(xiàn)了一些可能對(duì)食物過敏原產(chǎn)生耐受性機(jī)制，包括調(diào)節(jié)性T細(xì)胞的誘導(dǎo)；④ 該方面研究目前缺乏臨床資料，但在一些小型的早期研究表明，對(duì)于花生和牛奶的過敏患者，EPIT比其他特異性變應(yīng)原免疫治療方法更具有安全性；⑤ 該療法的目的是防止意外暴露于已知的食物過敏原。

背景:食物過敏的兒童在不干預(yù)的情況下自然地解決了一定比例的食物過敏問題;然而，控制兒童食物過敏持續(xù)或消除的潛在機(jī)制尚不清楚。目的:本研究旨在明確1歲時(shí)蛋類過敏相關(guān)的先天免疫概況，確定兒童期自然耐受發(fā)育過程中出現(xiàn)的表型變化，探討早期先天免疫功能與血清維生素D的關(guān)系。方法:本研究采用縱向的方法，從一組以人群為基礎(chǔ)的挑戰(zhàn)隊(duì)列中收集到的PBMC樣本，這些樣本被證實(shí)是雞蛋過敏的嬰兒，他們?cè)趦和瘯r(shí)期有持續(xù)性或短暫的雞蛋過敏的結(jié)果，并量化了與雞蛋過敏的臨床表型相關(guān)的功能性先天免疫反應(yīng)。結(jié)果:我們發(fā)現(xiàn)持續(xù)的雞蛋過敏的嬰兒表現(xiàn)出獨(dú)特的先天免疫特征，與短暫的雞蛋過敏的嬰兒相比，其特征是循環(huán)的單核細(xì)胞和樹突狀細(xì)胞數(shù)量增加，在基線和內(nèi)毒素暴露后產(chǎn)生更多的炎癥細(xì)胞因子。后續(xù)分析顯示，這種獨(dú)特的先天免疫特征在持續(xù)對(duì)雞蛋過敏的兒童中持續(xù)存在，并 在自然耐受形成過程中發(fā)揮免疫調(diào)節(jié)作用

食物過敏是一種常見病，影響約8%的兒童和5%的成年人。在過去的20年里，患病率增加了，這表明環(huán)境因素對(duì)易感性有重要影響。研究發(fā)現(xiàn)，出生模式、寵物接觸和有兄弟姐妹是食物過敏的重要危險(xiǎn)因素。隨著這些因素對(duì)腸道菌群的組成有顯著影響的發(fā)現(xiàn)，而腸道菌群在免疫系統(tǒng)的形成中起著至關(guān)重要的作用，最近的研究已經(jīng)開始探討腸道菌群在食物過敏發(fā)展中的作用。人類隊(duì)列的研究支持食物過敏的代謝失調(diào)，有限的數(shù)據(jù)表明這種代謝失調(diào)發(fā)生在生命早期，過敏發(fā)生之前。動(dòng)物模型的研究清楚地表明，腸道微生物群的組成對(duì)食物過敏的易感性有影響，還有一些微生物，比如梭狀芽胞桿菌，對(duì)食物過敏的發(fā)生具有保護(hù)作用。我們對(duì)微生物對(duì)食物過敏的調(diào)控的理解還在初步階段，但該領(lǐng)域的研究狀況支持了腸道微生物對(duì)過敏易感性的重要作用。今后面臨的挑戰(zhàn)是，如何鑒別出可用于預(yù)防或治療食物過敏的共生微生物。

最近開發(fā)的敏感、特異、非培養(yǎng)方法的用于識(shí)別微生物的工具的應(yīng)用正在改變微生物生態(tài)學(xué)的概念，包括與我們自身以及與健康和疾病狀態(tài)相關(guān)的大量復(fù)雜微生物種群之間的關(guān)系。盡管大多數(shù)最初的工作集中于胃腸道微生物群落和胃腸疾病的關(guān)系,但目前興趣已經(jīng)擴(kuò)大到包括研究哮喘及其表型與氣道微生物的關(guān)系，胃腸道微生物之間的關(guān)系,免疫功能的開發(fā)、過敏和哮喘傾向的研究。在此，我們提供了關(guān)于哮喘患者和健康受試者之間氣道微生物組差異研究，以及環(huán)境微生物組、腸道微生物組、免疫功能和哮喘進(jìn)展之間的關(guān)系的研究。此外，我們提供了有關(guān)這些發(fā)現(xiàn)建議如何建立涉及直接操作腸道和氣道微生物組來治療和預(yù)防過敏性哮喘的廣泛的基本原理。

PRACTALL是由美國過敏、哮喘與免疫學(xué)會(huì)(American Academy of Allergy, Asthma & Immunology)和歐洲過敏與臨床免疫學(xué)會(huì)(European Academy of Allergy and Clinical Immunology)聯(lián)合發(fā)起的，旨在就過敏癥與免疫學(xué)領(lǐng)域的前沿課題提供基于證據(jù)的共同建議。PRACTALL 2017側(cè)重于研究已證實(shí)的微生物在哮喘、特應(yīng)性皮炎和食物過敏患者中的作用。通過概述有關(guān)其在變應(yīng)性疾病中的作用的重要知識(shí)空白以及填補(bǔ)這些空白所必需的策略。此外，還將對(duì)處置微生物組的方法上的進(jìn)展進(jìn)行回顧，確定哪些是有效的，哪些是無效的，以及作為將來干預(yù)過敏性疾病形成、進(jìn)展或兩者的基礎(chǔ)。

人體的免疫系統(tǒng)對(duì)攝入的無害抗原，包括食物蛋白，通常不會(huì)出現(xiàn)局部和全身免疫反應(yīng)，這一過程被稱為口服耐受。對(duì)食物蛋白的耐受性可能與胃腸道對(duì)大量共生微生物的耐受性機(jī)制密切相關(guān)。在這里，我們回顧了目前對(duì)食物耐受的免疫機(jī)制的理解，以及這些機(jī)制中出現(xiàn)的干擾如何促進(jìn)食物耐受的喪失和食物過敏的發(fā)展。討論了共生菌群在促進(jìn)食物耐受中的作用以及腸道失調(diào)與食物過敏的關(guān)系。越來越多的證據(jù)支持皮膚對(duì)食物抗原的敏感性，認(rèn)為這可能是導(dǎo)致耐受不能形成或耐受喪失的一種機(jī)制。對(duì)食物過敏進(jìn)行免疫治療的目標(biāo)是通過一些機(jī)制誘導(dǎo)對(duì)食物過敏原的持續(xù)脫敏，甚至是產(chǎn)生真正的長期耐受性，這些機(jī)制可能在一定程度上與天然食物耐受性的形成相重疊。

腸道微生物群可能在牛奶過敏的自然病中起作用。我們?cè)噲D研究早期腸道微生物群與牛奶過敏之間的關(guān)系。我們研究了226名牛奶過敏的兒童，他們?cè)趮雰浩诰捅患{入食物過敏觀察研究組。收集3 - 16個(gè)月時(shí)的糞便樣本，對(duì)患兒進(jìn)行縱向隨訪，進(jìn)行臨床評(píng)估、牛奶特異性IgE水平、入組時(shí)、6個(gè)月、12個(gè)月、之后每年進(jìn)行一次，直到8歲。腸道微生物組采用16s rRNA測(cè)序，微生物組分析采用微生物生態(tài)學(xué)定量研究(QIIME)、群落系統(tǒng)發(fā)育研究(PICRUSt)和元基因組譜統(tǒng)計(jì)分析(STAMP)。

① 益生菌是活著的微生物，適量使用可以給予宿主健康上的好處；② 本文描述了益生菌在氣道中可能的作用機(jī)制，特別著重于它們調(diào)節(jié)上皮屏障功能的能力及其與免疫系統(tǒng)的相互作用模式；③ 益生菌，主要是乳酸桿菌，可以促進(jìn)緊密連接和粘附連接的表達(dá)和調(diào)節(jié)，從而恢復(fù)有缺陷的上皮屏障；④ 這些益生菌通過模式識(shí)別受體(如類toll受體)與上皮屏障和免疫細(xì)胞相互作用，激活后可刺激或抑制各種免疫反應(yīng)。